Laboratoř genetických základů biodiverzity – Ústav obecné genetiky

5) Vývoj nové platformy pro získávání vakcínových přípravků na bázi viru podobných částic (VLP).

Nejdůležitější úspěchy jednotky

1. Byla studována strukturní a funkční organizace a evoluční variabilita vnitřních a vnějších transkribovaných spacerů rDNA blízce příbuzných druhů švábů (řád Blattodea).

Je navržen nový model evoluční variability multigenových rodin, nazývaný “zvětšení a fixace”..

Mukha DV, Mysina V., Mavropulo V., Schal C. Struktura a molekulární evoluce externího transkribovaného spaceru ribozomální DNA v rodu švábů blattella. Genom. 2011; 54(3): 222-234. doi: 10.1139/G10-112.

2. Byla studována strukturní a funkční organizace a evoluční variabilita R1/R2 retrotransposonů hmyzu – zástupců řádu Blattodea. Je navržen nový model transpozice tohoto typu mobilních prvků, založený na rekombinaci mezi sesterskými chromatidami.

Mukha DV, Pasyukova EG, Kapelinskaya TV, Kagramanova AS Endonukleázová doména Drosophila melanogaster R2 non-LTR retrotransposon a související retroelementy: nový model pro transpozici. Přední Genet. 2013; 4:63.

3. Poprvé byly popsány krátké rozptýlené SINE (Sbg1 – Sbg9) v genomu německého švába B. germanica. Ukázalo se, že všechny popsané SINE mají tRNA promotory a jejich transkripční iniciace začíná na 11 bp. nad polem “A” těchto promotérů. Terminální sekvence Sbg2 a Sbg7 jsou poly(A) sekvence, zatímco všechny ostatní SINE B. germanica V této strukturální části retrotranspozony obsahují krátké tandemové repetice (STR). Ukázalo se, že některé z popsaných SINE a jejich degenerované kopie jsou lokalizovány jak v genových intronech, tak v lokusech známých jako piRNA clustery (piwi-interagující RNA). Ukázali jsme, že piRNA odvozené z klastrů piRNA mapují sedm z devíti typů SINE, které jsme popsali, včetně kopií SINE umístěných v genových intronech. Navrhujeme, aby SINE umístěné v intronech určitých genů mohly regulovat hladiny exprese těchto genů prostřednictvím molekulárního mechanismu souvisejícího s PIWI.

Firsov S.Y., Kosherova K.A., Mukha D.V. Identifikace a funkční charakteristika německého švába, blattella germanica, krátké rozptýlené jaderné prvky. PLoS One. 2022. června 13;17(6):e0266699. doi: 10.1371/journal.pone.0266699.

4. Byla provedena studie struktury populace červeného švába (blattella germánský). Ve studii byly použity tři typy molekulárně genetických markerů: netranskribovaný spacer rDNA, mikrosatelitní sekvence, 5′-zkrácené kopie R2 retrotransposonů.

Ukázalo se, že nejinformativnější je analýza polymorfismu 5′-zkrácených kopií mobilních prvků.

Oyun N. Yu., Zagoskina A. S., Mukha D. V. (2018) Analýza dědičnosti 5′-zkrácených kopií retrotranspozonu R2 v sérii generací německého švába blattella germánský // Genetics, vol. 54, no. 12–1. DOI: 8/S10.1134

Vargo EL, Crissman JR, Booth W., Santangelo RG, Mukha DV, Schal C. (2014) Hierarchická genetická analýza německého švába (blattella germanica) populace z budov až po kontinenty // PLoS One., 9(7):e102321. doi: 10.1371/journal.pone.0102321.

Mukha DV, Kagramanova AS, Lazebnaya IV, Lazebnyi OE, Vargo EL, Schal C. Vnitrodruhová variace a struktura populace švábů německého, blattella germanica, odhalila RFLP analýza netranskribované spacerové oblasti ribozomální DNA. Med Vet Entomol. 2007; 21(2): 132-140.

5. Byl objeven nový virus infikující německého švába (BgDV1). Je popsána strukturní organizace a strategie exprese tohoto viru. Pro studium funkce proteinů kódovaných genomem BgDV1 byly získány transgenní linie Drosophila obsahující v genomu cDNA genů regulačních i kapsidových proteinů studovaného viru.

Mukha DV, Chumachenko AG, Dykstra MJ, Kurtti TJ, Schal C. Charakterizace nového densoviru infikujícího německého švába, blattella germanica.

J Gen Virol. 2006;87(Pt 6):1567-1575.

Kapelinskaya TV, Martynova EU, Schal C., Mukha DV Strategie exprese viru densonukleózy z německého švába, blattella germanica. J. Virol. 2011;85(22):11855-11870. doi: 10.1128/JVI.05523-11.

6. Byly studovány vzorce exprese kapsidových proteinů německého švábího densoviru blattella germanica v buňkách savců a kvasinek.

Funkční význam jaderných lokalizačních signálů byl prokázán (NLS и NES) při intracelulární kompartmentalizaci kapsidových proteinů.

Kozlov EN, Martynova EU, Popenko VI, Schal C., Mukha DV (2018) Intracelulární lokalizace blattella germanica Densovirus (BgDV1) kapsidové proteiny //

Viry, 10(7). pii: E370. doi: 10.3390/v10070370.

Martynova E. U., Zotova M. I., Trostnikov M. V., Mukha D. V. (2018) Heterologní exprese kapsidového proteinu VP3 německého švábího densoviru v kvasinkových buňkách Saccharomyces cerevisiae: analýza intracelulární lokalizace // Genetika, 2018, ročník 54, příloha, str. S5–S9.

7. Bylo prokázáno, že lidská semenná tekutina obsahuje velké množství dvouvláknové RNA (dsRNA). V současné době laboratoř studuje vlastnosti nukleotidového složení popsaných molekul a jejich potenciální biologickou roli.

Zagoskin MV, Davis RE, Mukha DV (2017) Dvouřetězcová RNA v lidské seminální plazmě. Přední Genet. 8:154. doi: 10.3389/fgene.2017.00154.

8. Bylo ukázáno, že při expresi kapsidových proteinů BgDV1 v kvasinkových buňkách Saccharomyces cerevisiae dochází k tvorbě viru podobných částic (VLP). V současné době jsou vyvíjeny metodické přístupy, které umožňují zobrazení cizích antigenních determinant na povrchu vytvořeného HPV. Předpokládá se, že studované „hybridní“ HPV mohou být použity jako vakcíny nové generace.

Vybrané publikace

1) Firsov S.Y., Kosherova K.A., Mukha D.V. Identifikace a funkční charakteristika německého švába, blattella germanica, krátké rozptýlené jaderné prvky. PLoS One. 2022. června 13;17(6):e0266699. doi: 10.1371/journal.pone.0266699.

2) Kapun M, Nunez JCB, Bogaerts-Márquez M, Murga-Moreno J, Paris M, Outten J, Coronado-Zamora M, Tern C, Rota-Stabelli O, García Guerreiro MP, Casillas S, Orengo DJ, Puerma E, Kankare M, Ometto V Schpurt, J. Onderch, Abb. Behrman EL, Schou MF, Merritt TJS, Lazzaro BP, Glaser-Schmitt A, Argyridou E, Staubach F, Wang Y, Tauber E, Serga SV, Fabian DK, Dyer KA, Wheat CW, Parsch J, Grath S, Veselinovic MS, Stamenkovic-MADAK, Radak M, Gómez-Julián MJ, Espinosa-Jimenez ML, Gallardo-Jiménez FD, Patenkovic A, Eric K, Tanaskovic M, Ullastres A, Guio L, Merenciano M, Guirao-Rico S, Horváth V, Obbard DJ, Pasyukova E, Alatortsev VE, J Vieiras Maierchenko, Vieiras-R oreau C, Mukha DV, Machado HE, Lamb K, Paulo T, Yusuf L, Barbadilla A, Petrov D, Schmidt P, Gonzalez J, Flatt T, Bergland AO.

Drosophila Evolution over Space and Time (DEST) — Nový zdroj populační genomiky. Mol Biol Evol. 2021. září 1: msab259. doi: 10.1093/molbev/msab259.

3) Zagoskina, A.; Firsov, S.; Lazebnaja, I.; Lazebný, O.; Mukha, DV R2 a retrotranspozony německého švába nespecifické R2, blattella germanica. Geny, 2020. 11, 1202. https://doi.org/10.3390/genes11101202.

4) Kozlov EN, Martynova EU, Popenko VI, Schal C., Mukha DV Intracelulární lokalizace blattella germanica Densovirus (BgDV1) Capsid Proteins // Viry, 2018. 10(7). pii: E370. doi: 10.3390/v10070370.

5) Zagoskin MV, Davis RE, Mukha DV Double Stranded RNA in Human Seminal Plasma. Přední Genet. 2017. 8:154. doi: 10.3389/fgene.2017.00154.

6) Martynova EU, Schal C., Mukha DV Účinky rekombinace na fylogenezi densoviru // Arch. Virol., 2016. 161 (1): 63-75. doi: 10.1007/s00705-015-2642-5.

7) Zagoskin MV, Lazareva VI, Grishanin AK, Mukha DV Obsah fylogenetických informací opakujících se jednotek ribozomální DNA Copepoda: dopad ITS1 a ITS2. Biomed Res Int. 2014;2014:926342. doi: 10.1155/2014/926342.

8) Vargo EL, Crissman JR, Booth W., Santangelo RG, Mukha DV, Schal C. Hierarchická genetická analýza německého švába (blattella germanica) populace zevnitř budov až po celé kontinenty. PLoS One. 2014 Jul 14;9(7):e102321. doi: 10.1371/journal.pone.0102321.

9) Cotmore SF, Agbandje-McKenna M., Chiorini JA, Mukha DV, Pintel DJ, Qiu J., Soderlund-Venermo M., Tattersall P., Tijssen P., Gatherer D., Davison AJ Rodina Parvoviridae. // Archives of Virology, 2014, 159(5): 1239–1247 DOI: 10.1007/s00705-013-1914-1.

10) Mukha DV, Pasyukova EG, Kapelinskaya TV, Kagramanova AS Endonukleázová doména Drosophila melanogaster R2 non-LTR retrotransposon a související retroelementy: nový model pro transpozici. Přední Genet. 2013; 4:63. doi: 10.3389/fgene.2013.00063.

11) Kapelinskaya T., Martynova E., Schal C. a Mukha D. Strategie exprese viru densonukleózy z německého švába, blattella germanica. // Journal of Virology, 2011, Vol.

12) Mukha DV, Mysina V., Mavropulo V., Schal C. Struktura a molekulární evoluce externího transkribovaného spaceru ribozomální DNA v rodu švábů blattella. // Genom, 2011. V. 54, S. 222–234.

13) Booth, W., Santangelo, RG, Vargo, EL, Mukha, DV a Schal, C. Genetická struktura populace u německých švábů, blattella germanica: Diferencované ostrovy v zemědělské krajině. // Journal of Heredity, 2011, roč. 102, s. 175–183. (doi:10.1093/jhered/esq108).

14) Crissman JR, W. Booth, RG Santangelo, DV Mukha, EL Vargo a C. Schal. Genetická struktura populace švábů německého (Blattodea: Blattellidae) v bytových domech. // Journal of Medical Entomology, 2010, V.47, S. 553–564.

15) Pasyukova EG, Mukha DV Reoviru podobné dvouvláknové RNA frakce v a Drosophila melanogaster linie obsahující individuální druhý chromozom z přirozené populace // In book: Insect Viruses: Detection, Characterization and Roles, 2009, pp. 157-164.

16) Mukha DV, Kagramanova AS, Lazebnaya IV, Lazebnyi OE, Vargo EL, Schal C. Vnitrodruhová variace a struktura populace švábů německého, blattella germanica, odhalila RFLP analýza netranskribované spacerové oblasti ribozomální DNA. 2007, Med Vet Entomol., 21(2):132-40.

17) Mukha DV, Chumachenko AG, Dykstra MJ, Kurtti TJ a Schal C. Charakterizace nového densoviru infikujícího německého švába, Blattella germanicumA. Journal of General Virology, 2006, 87:1567-1575.

18) Mukha DV, Wiegmann BM, Schal C. Evoluce a obsah fylogenetické informace ribozomální jednotky opakování DNA v biochemii hmyzu a molekulární biologii Blattoidea (Insecta). 2002. V. 32. S. 951-960.

19) Mukha DV, Sidorenko AP, Lazebnaya IV, Wiegmann BM a Schal C. Analýza vnitrodruhového polymorfismu v ribozomálním shluku DNA švába Blattella germanica. Molekulární biologie hmyzu. 2000, 9: 217-222.

• Institut
  • Ředitelství
  • Divize
  • knihovna
  • Časopis “Genetika”
  • IOGen v médiích
  • Protikorupční
  • Volná místa ve výzkumu
  • Zásady IOGEN RAS týkající se zpracování osobních údajů
  • O organizaci vnitřního systému zajištění plnění požadavků antimonopolní legislativy
  • Kontakty
  • Akademická rada
  • Rada pro disertační práci
  • Podle genetiky a výběru
  • Etická komise
  • Rada mladých vědců
  • Programy a projekty
  • uveřejnění
  • Konference a školy
  • Semináře
  • Soutěže
  • Databáze
  • O Ústavu
  • Vyznamenání
  • Muzeum N.I. Vavilová
  • Komise pro zachování a rozvoj vědeckého dědictví akademika N.I. Vavilov Ruská akademie věd
  • Muzeum-kancelář ak. N.P. Dubinina
  • Pamětní stránky
  • Postgraduální studium
  • Cílený trénink
  • Žádost o zaměstnání
  • UC
  • MIPT
  • Moskevská státní univerzita
  • Petrohradská státní univerzita
  • TSHA
  • REC
  • Přednášky
  • Studenti
  • Učební materiály
  • Postgraduální přijímací kampaň 2024
  • Pro žadatele 2024
  • Velké vybavení
  • Software
  • Užitečné odkazy
  • Telefony
  • náležitosti
  • Finanční služby
  • Smluvní servis
  • Personální oddělení
  • Služební cesty
  • Regulační dokumenty
  • Formuláře interních dokumentů
  • Schvalovací list
  • Volná místa ve výzkumu
  • Z historie biologie za účasti IOGen: James V. Neel a Yuri E. Dubrova
  • Verze pro zrakově postižené

  Redakční rada webu www.vigg.ru
  Pravidla stanoviště
  Programování: A. Sokolov

  adresa:	119991, Moskva, st. Gubkina, 3
  E-mail:	[email protected]
  Technická podpora:	[email protected]
  telefon:	(499) 135 62–13
  Fax:	(499) 132-89-62, (499) 135-12-89

  Při použití materiálů jako celku nebo jejich částí je vyžadován odkaz na vigg.ru